首先，有機菌肥到底是什么：主要來源于植物或動物，施于土壤以提供植物營養為其主要功能的含碳物料。經生物物質、動植物廢棄物、植物殘體加工而成，消除了其中的有毒有害物質，含有大量有益物質，并且肥效長，可增加和更新土壤有機質，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質和生物活性，是綠色食品生產的主要養分。
    一、改善土壤理化性狀，提升土壤肥力有機肥含有大量有機質，通常含量為200g/kg左右。有機質是土壤肥力的重要物質基礎。
    二、促進土壤微生物活動土壤微生物在有機質轉化過程中起著重要的作用，是衡量土壤肥力水平的重要標志之一。如土壤中有機質的礦質化過程，土壤中有機態氮磷的有效化過程，豆科植物生物固氮過程等，都是與土壤微生物的作用相關。
    三、維持和促進土壤養分平衡植物從土壤中攝取的各類養分可通過施用有機肥料和以植物殘體形式回歸土壤?；貧w的程度怎樣，主要取決于各類有機肥源是不是充分積攢、合理積造施用及殘體回田率。
    四、降低肥料投入成本有機肥可就地取材、就地施用，來源廣、成本低，通過增施有機肥不僅僅能夠培肥地力，增加土壤養分，并且能夠提升化肥利用率，相對應降低化肥施用量，進而降低農業投入成本。